Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctf1Q60753 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms