Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn1P62962 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms