Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf4P11403 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 429.2 ms