Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FlgP11088 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FlgP11088 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FlgP11088 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FlgP11088 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FlgP11088 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FlgP11088 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FlgP11088 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FlgP11088 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FlgP11088 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FlgP11088 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FlgP11088 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FlgP11088 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FlgP11088 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FlgP11088 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FlgP11088 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FlgP11088 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FlgP11088 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FlgP11088 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FlgP11088 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FlgP11088 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FlgP11088 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FlgP11088 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FlgP11088 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FlgP11088 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FlgP11088 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FlgP11088 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FlgP11088 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FlgP11088 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FlgP11088 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FlgP11088 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms