Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.6 ms