Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BC035947B2RQY6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BC035947B2RQY6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms