Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms