Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms