Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plxnb3Q9QY40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxnb3Q9QY40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms