Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac4Q6NZM9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac4Q6NZM9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 613.1 ms