Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mre11Q61216 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mre11Q61216 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms