Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctf1Q60753 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctf1Q60753 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms