Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rmdn3Q3UJU9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rmdn3Q3UJU9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms