Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MestQ07646 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MestQ07646 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MestQ07646 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MestQ07646 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MestQ07646 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MestQ07646 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MestQ07646 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MestQ07646 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MestQ07646 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MestQ07646 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MestQ07646 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MestQ07646 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MestQ07646 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MestQ07646 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MestQ07646 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MestQ07646 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MestQ07646 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MestQ07646 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MestQ07646 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MestQ07646 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228 ms