Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Xrn1P97789 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Xrn1P97789 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Xrn1P97789 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms