Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb5P09079 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb5P09079 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms