Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700015F17RikD3YUK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700015F17RikD3YUK8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700015F17RikD3YUK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms