Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms