Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cited4Q9WUL8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cited4Q9WUL8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cited4Q9WUL8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cited4Q9WUL8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cited4Q9WUL8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cited4Q9WUL8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cited4Q9WUL8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cited4Q9WUL8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms