Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sorbs3Q9R1Z8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sorbs3Q9R1Z8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sorbs3Q9R1Z8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sorbs3Q9R1Z8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sorbs3Q9R1Z8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sorbs3Q9R1Z8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sorbs3Q9R1Z8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sorbs3Q9R1Z8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sorbs3Q9R1Z8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sorbs3Q9R1Z8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sorbs3Q9R1Z8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sorbs3Q9R1Z8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sorbs3Q9R1Z8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sorbs3Q9R1Z8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sorbs3Q9R1Z8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sorbs3Q9R1Z8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sorbs3Q9R1Z8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sorbs3Q9R1Z8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sorbs3Q9R1Z8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sorbs3Q9R1Z8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sorbs3Q9R1Z8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sorbs3Q9R1Z8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sorbs3Q9R1Z8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sorbs3Q9R1Z8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sorbs3Q9R1Z8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sorbs3Q9R1Z8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sorbs3Q9R1Z8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sorbs3Q9R1Z8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sorbs3Q9R1Z8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms