Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc5Q9R1X5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc5Q9R1X5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc5Q9R1X5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc5Q9R1X5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Abcc5Q9R1X5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc5Q9R1X5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc5Q9R1X5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc5Q9R1X5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc5Q9R1X5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Abcc5Q9R1X5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc5Q9R1X5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc5Q9R1X5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc5Q9R1X5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Abcc5Q9R1X5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc5Q9R1X5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc5Q9R1X5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc5Q9R1X5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc5Q9R1X5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Abcc5Q9R1X5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Abcc5Q9R1X5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Abcc5Q9R1X5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Abcc5Q9R1X5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Abcc5Q9R1X5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Abcc5Q9R1X5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Abcc5Q9R1X5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Abcc5Q9R1X5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Abcc5Q9R1X5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc5Q9R1X5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc5Q9R1X5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Abcc5Q9R1X5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Abcc5Q9R1X5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Abcc5Q9R1X5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Abcc5Q9R1X5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Abcc5Q9R1X5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Abcc5Q9R1X5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc5Q9R1X5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Abcc5Q9R1X5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc5Q9R1X5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Abcc5Q9R1X5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Abcc5Q9R1X5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Abcc5Q9R1X5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Abcc5Q9R1X5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Abcc5Q9R1X5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Abcc5Q9R1X5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Abcc5Q9R1X5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc5Q9R1X5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Abcc5Q9R1X5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Abcc5Q9R1X5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc5Q9R1X5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc5Q9R1X5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc5Q9R1X5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc5Q9R1X5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Abcc5Q9R1X5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Abcc5Q9R1X5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Abcc5Q9R1X5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Abcc5Q9R1X5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms