Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpc1Q9QZF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc1Q9QZF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc1Q9QZF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc1Q9QZF2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpc1Q9QZF2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpc1Q9QZF2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gpc1Q9QZF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gpc1Q9QZF2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc1Q9QZF2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc1Q9QZF2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc1Q9QZF2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpc1Q9QZF2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpc1Q9QZF2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gpc1Q9QZF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gpc1Q9QZF2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gpc1Q9QZF2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gpc1Q9QZF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpc1Q9QZF2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpc1Q9QZF2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpc1Q9QZF2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpc1Q9QZF2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpc1Q9QZF2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Gpc1Q9QZF2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc1Q9QZF2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gpc1Q9QZF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gpc1Q9QZF2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc1Q9QZF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpc1Q9QZF2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gpc1Q9QZF2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc1Q9QZF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc1Q9QZF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpc1Q9QZF2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc1Q9QZF2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc1Q9QZF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc1Q9QZF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpc1Q9QZF2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc1Q9QZF2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc1Q9QZF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc1Q9QZF2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc1Q9QZF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc1Q9QZF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc1Q9QZF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc1Q9QZF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc1Q9QZF2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms