Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kifc1Q9QWT9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kifc1Q9QWT9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kifc1Q9QWT9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kifc1Q9QWT9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kifc1Q9QWT9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kifc1Q9QWT9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kifc1Q9QWT9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kifc1Q9QWT9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Kifc1Q9QWT9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kifc1Q9QWT9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kifc1Q9QWT9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kifc1Q9QWT9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kifc1Q9QWT9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kifc1Q9QWT9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kifc1Q9QWT9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kifc1Q9QWT9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kifc1Q9QWT9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kifc1Q9QWT9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kifc1Q9QWT9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kifc1Q9QWT9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kifc1Q9QWT9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kifc1Q9QWT9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kifc1Q9QWT9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kifc1Q9QWT9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kifc1Q9QWT9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kifc1Q9QWT9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kifc1Q9QWT9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kifc1Q9QWT9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kifc1Q9QWT9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kifc1Q9QWT9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kifc1Q9QWT9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kifc1Q9QWT9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kifc1Q9QWT9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kifc1Q9QWT9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kifc1Q9QWT9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kifc1Q9QWT9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kifc1Q9QWT9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms