Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Stx6Q9JKK1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Stx6Q9JKK1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Stx6Q9JKK1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Stx6Q9JKK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Stx6Q9JKK1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Stx6Q9JKK1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Stx6Q9JKK1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Stx6Q9JKK1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Stx6Q9JKK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Stx6Q9JKK1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Stx6Q9JKK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Stx6Q9JKK1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Stx6Q9JKK1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Stx6Q9JKK1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Stx6Q9JKK1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Stx6Q9JKK1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Stx6Q9JKK1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Stx6Q9JKK1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Stx6Q9JKK1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Stx6Q9JKK1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Stx6Q9JKK1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Stx6Q9JKK1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Stx6Q9JKK1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Stx6Q9JKK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Stx6Q9JKK1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Stx6Q9JKK1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Stx6Q9JKK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Stx6Q9JKK1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Stx6Q9JKK1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Stx6Q9JKK1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Stx6Q9JKK1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Stx6Q9JKK1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Stx6Q9JKK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stx6Q9JKK1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stx6Q9JKK1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Stx6Q9JKK1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stx6Q9JKK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1338.6 ms