Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tm9sf3Q9ET30 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tm9sf3Q9ET30 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tm9sf3Q9ET30 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms