Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Tm9sf3Q9ET30 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tm9sf3Q9ET30 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tm9sf3Q9ET30 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Tm9sf3Q9ET30 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Tm9sf3Q9ET30 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Tm9sf3Q9ET30 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Tm9sf3Q9ET30 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tm9sf3Q9ET30 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tm9sf3Q9ET30 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Tm9sf3Q9ET30 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tm9sf3Q9ET30 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tm9sf3Q9ET30 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tm9sf3Q9ET30 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tm9sf3Q9ET30 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Tm9sf3Q9ET30 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tm9sf3Q9ET30 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tm9sf3Q9ET30 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tm9sf3Q9ET30 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tm9sf3Q9ET30 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tm9sf3Q9ET30 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tm9sf3Q9ET30 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tm9sf3Q9ET30 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Tm9sf3Q9ET30 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tm9sf3Q9ET30 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tm9sf3Q9ET30 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tm9sf3Q9ET30 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Tm9sf3Q9ET30 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tm9sf3Q9ET30 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tm9sf3Q9ET30 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tm9sf3Q9ET30 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Tm9sf3Q9ET30 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tm9sf3Q9ET30 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tm9sf3Q9ET30 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tm9sf3Q9ET30 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tm9sf3Q9ET30 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tm9sf3Q9ET30 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tm9sf3Q9ET30 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tm9sf3Q9ET30 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tm9sf3Q9ET30 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tm9sf3Q9ET30 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tm9sf3Q9ET30 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tm9sf3Q9ET30 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tm9sf3Q9ET30 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tm9sf3Q9ET30 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tm9sf3Q9ET30 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tm9sf3Q9ET30 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tm9sf3Q9ET30 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tm9sf3Q9ET30 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm9sf3Q9ET30 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm9sf3Q9ET30 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm9sf3Q9ET30 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tm9sf3Q9ET30 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tm9sf3Q9ET30 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm9sf3Q9ET30 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tm9sf3Q9ET30 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tm9sf3Q9ET30 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tm9sf3Q9ET30 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tm9sf3Q9ET30 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tm9sf3Q9ET30 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tm9sf3Q9ET30 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tm9sf3Q9ET30 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tm9sf3Q9ET30 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tm9sf3Q9ET30 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tm9sf3Q9ET30 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tm9sf3Q9ET30 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tm9sf3Q9ET30 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tm9sf3Q9ET30 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tm9sf3Q9ET30 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tm9sf3Q9ET30 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tm9sf3Q9ET30 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tm9sf3Q9ET30 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tm9sf3Q9ET30 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tm9sf3Q9ET30 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tm9sf3Q9ET30 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm9sf3Q9ET30 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tm9sf3Q9ET30 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tm9sf3Q9ET30 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm9sf3Q9ET30 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm9sf3Q9ET30 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm9sf3Q9ET30 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm9sf3Q9ET30 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm9sf3Q9ET30 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tm9sf3Q9ET30 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm9sf3Q9ET30 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm9sf3Q9ET30 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm9sf3Q9ET30 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tm9sf3Q9ET30 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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