Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tfip11Q9ERA6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tfip11Q9ERA6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tfip11Q9ERA6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Tfip11Q9ERA6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Tfip11Q9ERA6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tfip11Q9ERA6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tfip11Q9ERA6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tfip11Q9ERA6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tfip11Q9ERA6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tfip11Q9ERA6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tfip11Q9ERA6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tfip11Q9ERA6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tfip11Q9ERA6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tfip11Q9ERA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tfip11Q9ERA6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Tfip11Q9ERA6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tfip11Q9ERA6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tfip11Q9ERA6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tfip11Q9ERA6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tfip11Q9ERA6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tfip11Q9ERA6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tfip11Q9ERA6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Tfip11Q9ERA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tfip11Q9ERA6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tfip11Q9ERA6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tfip11Q9ERA6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tfip11Q9ERA6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tfip11Q9ERA6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tfip11Q9ERA6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tfip11Q9ERA6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tfip11Q9ERA6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tfip11Q9ERA6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tfip11Q9ERA6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tfip11Q9ERA6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Tfip11Q9ERA6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tfip11Q9ERA6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tfip11Q9ERA6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tfip11Q9ERA6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tfip11Q9ERA6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tfip11Q9ERA6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tfip11Q9ERA6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Tfip11Q9ERA6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tfip11Q9ERA6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Tfip11Q9ERA6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tfip11Q9ERA6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tfip11Q9ERA6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms