Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtp4Q9ER80 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtp4Q9ER80 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtp4Q9ER80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtp4Q9ER80 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtp4Q9ER80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtp4Q9ER80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtp4Q9ER80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtp4Q9ER80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtp4Q9ER80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtp4Q9ER80 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtp4Q9ER80 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtp4Q9ER80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtp4Q9ER80 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtp4Q9ER80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtp4Q9ER80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtp4Q9ER80 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtp4Q9ER80 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtp4Q9ER80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtp4Q9ER80 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtp4Q9ER80 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtp4Q9ER80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtp4Q9ER80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtp4Q9ER80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtp4Q9ER80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtp4Q9ER80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtp4Q9ER80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtp4Q9ER80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtp4Q9ER80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtp4Q9ER80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtp4Q9ER80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtp4Q9ER80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtp4Q9ER80 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtp4Q9ER80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtp4Q9ER80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtp4Q9ER80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtp4Q9ER80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtp4Q9ER80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms