Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn12Q9ER56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Capn12Q9ER56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn12Q9ER56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capn12Q9ER56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Capn12Q9ER56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn12Q9ER56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capn12Q9ER56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Capn12Q9ER56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Capn12Q9ER56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capn12Q9ER56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capn12Q9ER56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn12Q9ER56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn12Q9ER56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn12Q9ER56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capn12Q9ER56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Capn12Q9ER56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn12Q9ER56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn12Q9ER56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn12Q9ER56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn12Q9ER56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capn12Q9ER56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn12Q9ER56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn12Q9ER56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn12Q9ER56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn12Q9ER56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn12Q9ER56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Capn12Q9ER56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Capn12Q9ER56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn12Q9ER56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn12Q9ER56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn12Q9ER56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn12Q9ER56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms