Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ndst4Q9EQW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ndst4Q9EQW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ndst4Q9EQW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ndst4Q9EQW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ndst4Q9EQW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ndst4Q9EQW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ndst4Q9EQW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ndst4Q9EQW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ndst4Q9EQW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ndst4Q9EQW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ndst4Q9EQW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ndst4Q9EQW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ndst4Q9EQW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ndst4Q9EQW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ndst4Q9EQW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ndst4Q9EQW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ndst4Q9EQW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ndst4Q9EQW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ndst4Q9EQW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ndst4Q9EQW8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ndst4Q9EQW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ndst4Q9EQW8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ndst4Q9EQW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ndst4Q9EQW8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ndst4Q9EQW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ndst4Q9EQW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ndst4Q9EQW8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ndst4Q9EQW8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ndst4Q9EQW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ndst4Q9EQW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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Ndst4Q9EQW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ndst4Q9EQW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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Ndst4Q9EQW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ndst4Q9EQW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ndst4Q9EQW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ndst4Q9EQW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Ndst4Q9EQW8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ndst4Q9EQW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ndst4Q9EQW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ndst4Q9EQW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ndst4Q9EQW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ndst4Q9EQW8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ndst4Q9EQW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ndst4Q9EQW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ndst4Q9EQW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ndst4Q9EQW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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