Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Riok3Q9DBU3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Riok3Q9DBU3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Riok3Q9DBU3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok3Q9DBU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok3Q9DBU3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok3Q9DBU3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Riok3Q9DBU3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Riok3Q9DBU3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Riok3Q9DBU3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok3Q9DBU3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok3Q9DBU3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok3Q9DBU3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Riok3Q9DBU3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Riok3Q9DBU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Riok3Q9DBU3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Riok3Q9DBU3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Riok3Q9DBU3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Riok3Q9DBU3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Riok3Q9DBU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Riok3Q9DBU3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Riok3Q9DBU3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Riok3Q9DBU3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riok3Q9DBU3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Riok3Q9DBU3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Riok3Q9DBU3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Riok3Q9DBU3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Riok3Q9DBU3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Riok3Q9DBU3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Riok3Q9DBU3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Riok3Q9DBU3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Riok3Q9DBU3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Riok3Q9DBU3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Riok3Q9DBU3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms