Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nsmce1Q9D720 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nsmce1Q9D720 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nsmce1Q9D720 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nsmce1Q9D720 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nsmce1Q9D720 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nsmce1Q9D720 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nsmce1Q9D720 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nsmce1Q9D720 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nsmce1Q9D720 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nsmce1Q9D720 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nsmce1Q9D720 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsmce1Q9D720 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nsmce1Q9D720 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsmce1Q9D720 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nsmce1Q9D720 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nsmce1Q9D720 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nsmce1Q9D720 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nsmce1Q9D720 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nsmce1Q9D720 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsmce1Q9D720 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nsmce1Q9D720 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nsmce1Q9D720 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nsmce1Q9D720 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsmce1Q9D720 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nsmce1Q9D720 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nsmce1Q9D720 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nsmce1Q9D720 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms