Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MceeQ9D1I5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MceeQ9D1I5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MceeQ9D1I5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MceeQ9D1I5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MceeQ9D1I5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MceeQ9D1I5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MceeQ9D1I5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MceeQ9D1I5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MceeQ9D1I5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MceeQ9D1I5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MceeQ9D1I5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MceeQ9D1I5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MceeQ9D1I5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MceeQ9D1I5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MceeQ9D1I5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MceeQ9D1I5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MceeQ9D1I5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MceeQ9D1I5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MceeQ9D1I5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MceeQ9D1I5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MceeQ9D1I5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MceeQ9D1I5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MceeQ9D1I5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MceeQ9D1I5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MceeQ9D1I5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MceeQ9D1I5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MceeQ9D1I5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MceeQ9D1I5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MceeQ9D1I5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MceeQ9D1I5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MceeQ9D1I5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MceeQ9D1I5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MceeQ9D1I5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MceeQ9D1I5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MceeQ9D1I5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MceeQ9D1I5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MceeQ9D1I5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MceeQ9D1I5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MceeQ9D1I5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MceeQ9D1I5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MceeQ9D1I5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MceeQ9D1I5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MceeQ9D1I5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MceeQ9D1I5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MceeQ9D1I5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MceeQ9D1I5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MceeQ9D1I5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MceeQ9D1I5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MceeQ9D1I5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MceeQ9D1I5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms