Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc2Q9CX47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc2Q9CX47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc2Q9CX47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc2Q9CX47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc2Q9CX47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrcc2Q9CX47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc2Q9CX47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc2Q9CX47 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc2Q9CX47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xrcc2Q9CX47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xrcc2Q9CX47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc2Q9CX47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xrcc2Q9CX47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc2Q9CX47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc2Q9CX47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc2Q9CX47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc2Q9CX47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc2Q9CX47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc2Q9CX47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc2Q9CX47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrcc2Q9CX47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc2Q9CX47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc2Q9CX47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc2Q9CX47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms