Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a2Q9CTG6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a2Q9CTG6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a2Q9CTG6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a2Q9CTG6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a2Q9CTG6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a2Q9CTG6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a2Q9CTG6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a2Q9CTG6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a2Q9CTG6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a2Q9CTG6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a2Q9CTG6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp13a2Q9CTG6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a2Q9CTG6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a2Q9CTG6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a2Q9CTG6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a2Q9CTG6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a2Q9CTG6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp13a2Q9CTG6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a2Q9CTG6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a2Q9CTG6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a2Q9CTG6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a2Q9CTG6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a2Q9CTG6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a2Q9CTG6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a2Q9CTG6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a2Q9CTG6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a2Q9CTG6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms