Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG3

Zmynd19, Zinc finger MYND domain-containing protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmynd19Q9CQG3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zmynd19Q9CQG3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zmynd19Q9CQG3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zmynd19Q9CQG3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zmynd19Q9CQG3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zmynd19Q9CQG3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zmynd19Q9CQG3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zmynd19Q9CQG3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmynd19Q9CQG3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zmynd19Q9CQG3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmynd19Q9CQG3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmynd19Q9CQG3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmynd19Q9CQG3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmynd19Q9CQG3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmynd19Q9CQG3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmynd19Q9CQG3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zmynd19Q9CQG3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmynd19Q9CQG3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmynd19Q9CQG3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zmynd19Q9CQG3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmynd19Q9CQG3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zmynd19Q9CQG3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms