Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ88

Tspan31, Tetraspanin-31, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan31Q9CQ88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan31Q9CQ88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan31Q9CQ88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan31Q9CQ88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan31Q9CQ88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan31Q9CQ88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan31Q9CQ88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan31Q9CQ88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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Tspan31Q9CQ88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan31Q9CQ88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan31Q9CQ88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan31Q9CQ88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan31Q9CQ88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan31Q9CQ88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan31Q9CQ88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan31Q9CQ88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tspan31Q9CQ88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan31Q9CQ88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan31Q9CQ88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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Tspan31Q9CQ88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan31Q9CQ88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan31Q9CQ88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan31Q9CQ88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Tspan31Q9CQ88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Tspan31Q9CQ88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan31Q9CQ88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Tspan31Q9CQ88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan31Q9CQ88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan31Q9CQ88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan31Q9CQ88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Tspan31Q9CQ88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan31Q9CQ88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan31Q9CQ88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan31Q9CQ88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms