Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcg5Q99PE8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg5Q99PE8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg5Q99PE8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg5Q99PE8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcg5Q99PE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcg5Q99PE8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcg5Q99PE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcg5Q99PE8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcg5Q99PE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg5Q99PE8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg5Q99PE8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcg5Q99PE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg5Q99PE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg5Q99PE8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg5Q99PE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcg5Q99PE8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcg5Q99PE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcg5Q99PE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcg5Q99PE8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg5Q99PE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg5Q99PE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg5Q99PE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcg5Q99PE8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg5Q99PE8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg5Q99PE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg5Q99PE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcg5Q99PE8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms