Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GpnmbQ99P91 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GpnmbQ99P91 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GpnmbQ99P91 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GpnmbQ99P91 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GpnmbQ99P91 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GpnmbQ99P91 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GpnmbQ99P91 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GpnmbQ99P91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GpnmbQ99P91 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GpnmbQ99P91 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GpnmbQ99P91 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GpnmbQ99P91 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GpnmbQ99P91 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GpnmbQ99P91 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GpnmbQ99P91 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GpnmbQ99P91 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GpnmbQ99P91 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GpnmbQ99P91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GpnmbQ99P91 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GpnmbQ99P91 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GpnmbQ99P91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GpnmbQ99P91 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GpnmbQ99P91 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GpnmbQ99P91 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GpnmbQ99P91 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GpnmbQ99P91 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GpnmbQ99P91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GpnmbQ99P91 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GpnmbQ99P91 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GpnmbQ99P91 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GpnmbQ99P91 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GpnmbQ99P91 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GpnmbQ99P91 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GpnmbQ99P91 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GpnmbQ99P91 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GpnmbQ99P91 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms