Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a8Q99N10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a8Q99N10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a8Q99N10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a8Q99N10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a8Q99N10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a8Q99N10 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a8Q99N10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a8Q99N10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a8Q99N10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a8Q99N10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a8Q99N10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a8Q99N10 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a8Q99N10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a8Q99N10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a8Q99N10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a8Q99N10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a8Q99N10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a8Q99N10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a8Q99N10 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms