Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp11Q99K46 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp11Q99K46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp11Q99K46 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp11Q99K46 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp11Q99K46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp11Q99K46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp11Q99K46 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp11Q99K46 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp11Q99K46 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp11Q99K46 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp11Q99K46 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp11Q99K46 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp11Q99K46 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp11Q99K46 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp11Q99K46 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp11Q99K46 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp11Q99K46 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp11Q99K46 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp11Q99K46 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp11Q99K46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp11Q99K46 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp11Q99K46 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp11Q99K46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp11Q99K46 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp11Q99K46 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp11Q99K46 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp11Q99K46 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp11Q99K46 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp11Q99K46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp11Q99K46 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms