Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smim11aQ99J19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smim11aQ99J19 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smim11aQ99J19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smim11aQ99J19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smim11aQ99J19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smim11aQ99J19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smim11aQ99J19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smim11aQ99J19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smim11aQ99J19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smim11aQ99J19 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smim11aQ99J19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smim11aQ99J19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smim11aQ99J19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smim11aQ99J19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smim11aQ99J19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smim11aQ99J19 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smim11aQ99J19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smim11aQ99J19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smim11aQ99J19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim11aQ99J19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim11aQ99J19 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smim11aQ99J19 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smim11aQ99J19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smim11aQ99J19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smim11aQ99J19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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