Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atad3Q925I1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atad3Q925I1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atad3Q925I1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad3Q925I1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atad3Q925I1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atad3Q925I1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atad3Q925I1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atad3Q925I1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atad3Q925I1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad3Q925I1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad3Q925I1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad3Q925I1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atad3Q925I1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atad3Q925I1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad3Q925I1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad3Q925I1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad3Q925I1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atad3Q925I1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atad3Q925I1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atad3Q925I1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atad3Q925I1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atad3Q925I1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atad3Q925I1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms