Protein–RNA interactions for Protein: Q924N4

Slc12a6, Solute carrier family 12 member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a6Q924N4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc12a6Q924N4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc12a6Q924N4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc12a6Q924N4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc12a6Q924N4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc12a6Q924N4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc12a6Q924N4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc12a6Q924N4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc12a6Q924N4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc12a6Q924N4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc12a6Q924N4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc12a6Q924N4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc12a6Q924N4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc12a6Q924N4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc12a6Q924N4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc12a6Q924N4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc12a6Q924N4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc12a6Q924N4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc12a6Q924N4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc12a6Q924N4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc12a6Q924N4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc12a6Q924N4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc12a6Q924N4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc12a6Q924N4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc12a6Q924N4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc12a6Q924N4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc12a6Q924N4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc12a6Q924N4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc12a6Q924N4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms