Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usb1Q91W78 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usb1Q91W78 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usb1Q91W78 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usb1Q91W78 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usb1Q91W78 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usb1Q91W78 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usb1Q91W78 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Usb1Q91W78 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usb1Q91W78 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usb1Q91W78 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usb1Q91W78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usb1Q91W78 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usb1Q91W78 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usb1Q91W78 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usb1Q91W78 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usb1Q91W78 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usb1Q91W78 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usb1Q91W78 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usb1Q91W78 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usb1Q91W78 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usb1Q91W78 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usb1Q91W78 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usb1Q91W78 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usb1Q91W78 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usb1Q91W78 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usb1Q91W78 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usb1Q91W78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usb1Q91W78 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usb1Q91W78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usb1Q91W78 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usb1Q91W78 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usb1Q91W78 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usb1Q91W78 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms