Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ppargc1bQ8VHJ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms