Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup58Q8R332 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup58Q8R332 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup58Q8R332 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup58Q8R332 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nup58Q8R332 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup58Q8R332 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup58Q8R332 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup58Q8R332 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup58Q8R332 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup58Q8R332 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup58Q8R332 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup58Q8R332 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup58Q8R332 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup58Q8R332 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nup58Q8R332 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup58Q8R332 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup58Q8R332 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nup58Q8R332 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup58Q8R332 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup58Q8R332 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup58Q8R332 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup58Q8R332 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup58Q8R332 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup58Q8R332 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup58Q8R332 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup58Q8R332 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup58Q8R332 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup58Q8R332 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup58Q8R332 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup58Q8R332 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup58Q8R332 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup58Q8R332 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup58Q8R332 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup58Q8R332 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup58Q8R332 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup58Q8R332 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup58Q8R332 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup58Q8R332 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup58Q8R332 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup58Q8R332 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup58Q8R332 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup58Q8R332 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms