Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W0

Babam2, BRISC and BRCA1-A complex member 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam2Q8K3W0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Babam2Q8K3W0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Babam2Q8K3W0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Babam2Q8K3W0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Babam2Q8K3W0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Babam2Q8K3W0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Babam2Q8K3W0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Babam2Q8K3W0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Babam2Q8K3W0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Babam2Q8K3W0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Babam2Q8K3W0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Babam2Q8K3W0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Babam2Q8K3W0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam2Q8K3W0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam2Q8K3W0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Babam2Q8K3W0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam2Q8K3W0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms