Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clip4Q8CI96 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip4Q8CI96 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip4Q8CI96 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Clip4Q8CI96 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip4Q8CI96 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip4Q8CI96 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip4Q8CI96 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip4Q8CI96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip4Q8CI96 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip4Q8CI96 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clip4Q8CI96 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip4Q8CI96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clip4Q8CI96 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip4Q8CI96 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip4Q8CI96 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip4Q8CI96 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip4Q8CI96 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip4Q8CI96 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip4Q8CI96 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip4Q8CI96 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip4Q8CI96 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip4Q8CI96 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip4Q8CI96 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip4Q8CI96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip4Q8CI96 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip4Q8CI96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms