Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam161bQ8CB59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam161bQ8CB59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam161bQ8CB59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fam161bQ8CB59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam161bQ8CB59 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam161bQ8CB59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam161bQ8CB59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam161bQ8CB59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam161bQ8CB59 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam161bQ8CB59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam161bQ8CB59 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam161bQ8CB59 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam161bQ8CB59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam161bQ8CB59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam161bQ8CB59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fam161bQ8CB59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam161bQ8CB59 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam161bQ8CB59 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam161bQ8CB59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam161bQ8CB59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam161bQ8CB59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fam161bQ8CB59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam161bQ8CB59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam161bQ8CB59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam161bQ8CB59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam161bQ8CB59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam161bQ8CB59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam161bQ8CB59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam161bQ8CB59 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fam161bQ8CB59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam161bQ8CB59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam161bQ8CB59 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam161bQ8CB59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam161bQ8CB59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam161bQ8CB59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms