Protein–RNA interactions for Protein: Q8C811

Slc35e2, Solute carrier family 35 member E2, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e2Q8C811 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc35e2Q8C811 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc35e2Q8C811 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc35e2Q8C811 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc35e2Q8C811 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc35e2Q8C811 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc35e2Q8C811 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc35e2Q8C811 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc35e2Q8C811 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc35e2Q8C811 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc35e2Q8C811 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc35e2Q8C811 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc35e2Q8C811 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc35e2Q8C811 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc35e2Q8C811 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc35e2Q8C811 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc35e2Q8C811 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc35e2Q8C811 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35e2Q8C811 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc35e2Q8C811 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc35e2Q8C811 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc35e2Q8C811 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc35e2Q8C811 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc35e2Q8C811 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc35e2Q8C811 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc35e2Q8C811 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc35e2Q8C811 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc35e2Q8C811 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc35e2Q8C811 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc35e2Q8C811 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc35e2Q8C811 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc35e2Q8C811 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc35e2Q8C811 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc35e2Q8C811 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc35e2Q8C811 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc35e2Q8C811 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc35e2Q8C811 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms